Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18529 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18529 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18529 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18529 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms