Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18526 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18526 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18526 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18526 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18526 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18526 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms