Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms