Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrphP15331 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrphP15331 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrphP15331 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrphP15331 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrphP15331 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrphP15331 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrphP15331 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrphP15331 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrphP15331 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrphP15331 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrphP15331 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrphP15331 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrphP15331 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms