Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp54P14576 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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