Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnmt1P13864 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnmt1P13864 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt1P13864 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms