Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms