Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DmdP11531 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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DmdP11531 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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DmdP11531 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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DmdP11531 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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DmdP11531 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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DmdP11531 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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DmdP11531 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DmdP11531 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DmdP11531 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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