Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fgf4P11403 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms