Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nid1P10493 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nid1P10493 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms