Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P10404 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
P10404 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
P10404 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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