Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Schip1P0DPB4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Schip1P0DPB4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms