Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CatspereP0DP43 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CatspereP0DP43 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms