Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ndufb1P0DN34 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms