Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Amd1P0DMN7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amd1P0DMN7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms