Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxb7P09024 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxb7P09024 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms