Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApoeP08226 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms