Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms