Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Tgfb1P04202 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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