Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01809 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01809 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01809 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01809 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01809 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01809 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01809 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01809 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01809 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms