Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01807 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01807 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01807 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01807 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01807 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01807 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01807 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01807 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01807 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01807 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01807 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01807 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms