Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01678 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01678 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01678 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01678 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01678 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01678 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01678 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01678 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms