Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01629 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01629 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01629 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01629 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01629 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01629 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01629 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01629 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01629 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01629 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01629 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01629 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01629 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms