Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FosP01101 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FosP01101 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FosP01101 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FosP01101 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FosP01101 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms