Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp1O89090 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms