Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShdO88834 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShdO88834 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShdO88834 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShdO88834 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShdO88834 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShdO88834 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShdO88834 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShdO88834 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShdO88834 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms