Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dll3O88516 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dll3O88516 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dll3O88516 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms