Protein–RNA interactions for Protein: O70400

Pdlim1, PDZ and LIM domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim1O70400 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdlim1O70400 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdlim1O70400 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms