Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Foxq1O70220 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Foxq1O70220 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxq1O70220 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms