Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChkbO55229 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChkbO55229 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms