Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms