Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Supt5hO55201 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Supt5hO55201 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms