Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pja1O55176 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms