Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syngr2O55101 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms