Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copb2O55029 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms