Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BckdkO55028 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BckdkO55028 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BckdkO55028 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms