Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms