Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SlkO54988 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SlkO54988 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SlkO54988 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SlkO54988 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SlkO54988 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SlkO54988 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SlkO54988 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SlkO54988 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms