Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb3O54890 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms