Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms