Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag2O35638 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms