Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcc1O35379 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms