Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna3O35344 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna3O35344 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms