Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Nedd9O35177 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nedd9O35177 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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