Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ArxO35085 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ArxO35085 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ArxO35085 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ArxO35085 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ArxO35085 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ArxO35085 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ArxO35085 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms