Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtgisO35074 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtgisO35074 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms