Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms