Protein–RNA interactions for Protein: O09164

Sod3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod3O09164 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sod3O09164 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sod3O09164 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sod3O09164 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms