Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurod4O09105 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neurod4O09105 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms