Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcm2O09102 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcm2O09102 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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